Высший орган – общее собрание. Исполнительно-распорядительные органы – Совет Центра и председатель Центра, избираемые общим собранием. В составе Центра 34 человека, включая членов Центра в районах области, и более 20 человек волонтёров. Образованы отделения Центра в четырёх районах области.
Председатель Центра – Куперман Марк Александрович, строитель-монтажник, экономист, менеджер, юрист. Заместитель председателя – Третьякова Рита Владимировна, филолог, экономист, юрист, общественный деятель. Члены Совета Центра: Кашпрук Владимир Андреевич, руководитель общественной приёмной центра, биолог, эколог, журналист, юрист; Золочевский Сергей Михайлович, строитель, специалист по вопросам ЖКХ. Константинов Фёдор Иванович, геофизик, эколог. Офис-менеджер: Томилов Анатолий Николаевич. Руководитель молодёжной секции – Терюков Евгений Олегович. Ответственный за работу по защите политических прав, включая право на местное самоуправление –Сидоров Николай Николаевич. Представитель Центра в квалификационной коллегии судей Сахалинской области- Каплий Нина Васильевна. Членов Центра, имеющих юридическое образование – 12 чел.
Направления работы: мониторинг прав человека на территории области, включая выявление наиболее острых вопросов – массовых или грубых нарушений прав. Мониторинг обеспечения прав наиболее уязвимых групп населения (психически больные, лица, содержащиеся в пенитенциарных учреждениях (заключенные, подследственные, содержащиеся в милиции, приютах, и т.п.), пожилые, инвалиды, дети, коренные малочисленные народы, военнослужащие срочной службы). Мониторинг проявлений межнациональной и межконфессиональной ксенофобии.
Готовятся доклады о состоянии прав человека в обдасти – как в целом, так и по отдельным вопросам. Установлены партнёрских отношений с местными специализированными организациями, защищающими права отдельных категорий населения (Движение пенсионеров «Совесть»,Совет солдатских матерей, Экологическая вахта Сахалина и другие экологические организации, Сахалинский Союз малых предпринимателей, Центр поддержки малого и среднего бизнеса, Лаборатория инновационных технологий, и др.).
Распространение информации о состоянии обеспечения прав человека на территории области и общей правозащитной информации – посредством публикаций в СМИ, проведением встреч и бесед со студентами, старшеклассниками, иными целевыми группами населения, размещением материалов в секторе правовой информации областной публичной библиотеки. Конструктивное сотрудничество с органами власти (органы прокуратуры, милиции, УИН, губернатор и органы Администрации области, областная Дума, главный федеральный инспектор по Сахалинской области, территориальные органы федеральных ведомств (антимонопольное управление, Россаннадзор и др), муниципальными органами власти - для решения вопросов защиты прав человека, устранения выявленных нарушений прав и интересов жителей области и иных лиц. Сотрудничество с общественными и политическими организациями, депутатами, обществом «Знание», Центром научно-технической информации в вопросах проведения совместных кампаний и акций, в том числе для организации работы образованных по нашей инициативе противокоррупционной и антифашистской каолиций.
Поддержание работы общественной приёмной для помощи гражданам, в первую очередь из числа наиболее уязвимых групп населения, в правовой защите их интересов; в отдельных случаях представляются интересы таких лиц в органах власти, в том числе в судах. Ежегодно правовая помощь оказывается примерно 1200 чел, в том числе с участием в 30-40 судебных процессов. Продвижение введения в области института регионального Уполномоченного по правам Человека.
Поддержание партнёрских отношений с федеральными общественными правозащитными организациями – Московской Хельсинкской Группой, Движением «За права человека», Комитетом «За гражданские права», ассоциацией «Мы - граждане», Санкт-Петербургским гуманитарно-политологическим Центром «Стратегия», Пермской Гражданской палатой, Екатеринбургским центром «Сутяжник», Фондом защиты заключенных, Центром «Демос», Экспертно-правовым Советом, Центром содействия международной защите, Международной Хельсинкской Федерацией.
Коммерческую деятельность Центр не ведёт, существует только на пожертвования, которые могут быть перечислены на вышеуказанные реквизиты Сбербанка, или внесены наличными в часы работы общественной приёмной. На внесённые деньги могут быть выданы подтверждающие документы, а на целевые пожертвования может быть представлен отчет об их расходовании. Однако никакие предварительные условия для пожертвований не принимаются, за исключением случаев, когда проводятся целевые сборы. Приветствуются пожертвования оргтехники, софта, картриджей, бумаги, канцпринадлежностей, правовой литературы, мебели.